Desde 1985 a 1988 ocupó el cargo de secretaro general de la central campesina "2 de agosto".

Entre 1991 y 1995 fue secretario de organización de la Central Obrera Departamental (COD) de Cochabamba.

Desde 1993, es presidente del Consejo Andino de Productores de Coca.

En 1994 alcanzó el cargo que mantiene hasta hoy y que lo ha convertido en el dirigente sindical más importante del país: Presidente de las cinco federaciones del Trópico de Cochabamba.

En 1997 participa por primera vez en unas elecciones como candidato a diputado uninominal por la circunscripción 27 de Cochabamba. Bajo la sigla de IU obtiene el récord nacional de votos: 61.3%.

A fines de febrero de este año, después de los graves enfrentamientos entre cocaleros y militares en Sacaba, Evo Morales es expulsado del Parlamento con la acusación de haber cometido faltas éticas.
El 2002, Morales candidatea por primera vez a la presidencia de la república con la sigla del MAS, partido del cual es jefe.